We will learn computational methods -- algorithms and data structures -- for analyzing DNA sequencing data. We will learn a little about DNA, genomics, and how DNA sequencing is used. We will use Python to implement key algorithms and data structures and to analyze real genomes and DNA sequencing datasets.
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Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.
Aprox. 12 horas para completar
Inglês
Legendas: Árabe, Francês, Portuguese (European), Italiano, Vietnamita, Alemão, Russo, Inglês, Espanhol
Habilidades que você terá
- Bioinformatics Algorithms
- Algorithms
- Python Programming
- Algorithms On Strings
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Universidade Johns Hopkins
The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world.
Programa - O que você aprenderá com este curso
4 horas para concluir
DNA sequencing, strings and matching
This module we begin our exploration of algorithms for analyzing DNA sequencing data. We'll discuss DNA sequencing technology, its past and present, and how it works.
4 horas para concluir
19 vídeos (Total 112 mín.), 7 leituras, 2 testes
3 horas para concluir
Preprocessing, indexing and approximate matching
In this module, we learn useful and flexible new algorithms for solving the exact and approximate matching problems. We'll start by learning Boyer-Moore, a fast and very widely used algorithm for exact matching
3 horas para concluir
15 vídeos (Total 114 mín.), 1 leitura, 2 testes
3 horas para concluir
Edit distance, assembly, overlaps
This week we finish our discussion of read alignment by learning about algorithms that solve both the edit distance problem and related biosequence analysis problems, like global and local alignment.
3 horas para concluir
13 vídeos (Total 92 mín.), 1 leitura, 2 testes
3 horas para concluir
Algorithms for assembly
In the last module we began our discussion of the assembly problem and we saw a couple basic principles behind it. In this module, we'll learn a few ways to solve the alignment problem.
3 horas para concluir
13 vídeos (Total 83 mín.), 1 leitura, 2 testes
Avaliações
- 5 stars80,75%
- 4 stars14,87%
- 3 stars3%
- 2 stars0,50%
- 1 star0,87%
Principais avaliações do ALGORITMOS APLICADO AO SEQUENCIAMENTO DE DNA
por KP18 de mai de 2020
Very good course this is. Just a little advice, please make the quiz questions more clear and more specific because one shouldn't waste time to understand a question which is very easy to implement.
por SS3 de jul de 2018
Very well prepared, from basics up to all commonly used techniques in bioinformatics. Prerequisites in Python is a plus, but not even necessary.
por NF9 de mar de 2021
very engaging and well-presented course material.
intermediate difficulty while conveying the basics of how even recent real-world genome alignment and assembly tools work. great course design!
por MD9 de nov de 2016
This was really fun. Really enjoyed the a-ha of the algorithms and the fun of solving the alignment and assembly problems. Feel mildly powerful after assembling a virus genome.
Perguntas Frequentes – FAQ
Quando terei acesso às palestras e às tarefas?
O que recebo ao me inscrever nesta Especialização?
Existe algum auxílio financeiro disponível?
Mais dúvidas? Visite o Central de Ajuda ao estudante.
