How do we infer which genes orchestrate various processes in the cell? How did humans migrate out of Africa and spread around the world? In this class, we will see that these two seemingly different questions can be addressed using similar algorithmic and machine learning techniques arising from the general problem of dividing data points into distinct clusters.
Este curso faz parte do Programa de cursos integrados Bioinformática
oferecido por
Programa de cursos integrados BioinformáticaUniversidade da Califórnia, San DiegoInformações sobre o curso
5,216 visualizações recentes
Resultados de carreira do aprendiz
33%
consegui um benefício significativo de carreira com este curso
Certificados compartilháveis
Tenha o certificado após a conclusão
100% on-line
Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.
Curso 5 de 7 no
Prazos flexíveis
Redefinir os prazos de acordo com sua programação.
Nível iniciante
Aprox. 10 horas para completar
Inglês
Legendas: Árabe, Francês, Português (Brasil), Italiano, Vietnamita, Coreano, Alemão, Russo, Turco, Inglês, Espanhol, Chinês
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Nível iniciante
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oferecido por
Universidade da Califórnia, San Diego
UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory.
Programa - O que você aprenderá com este curso
5 horas para concluir
Week 1: Introduction to Clustering Algorithms
<p>Welcome to class!</p><p>At the beginning of the class, we will see how algorithms for <strong>clustering </strong>a set of data points will help us determine how yeast became such good wine-makers. At the bottom of this email is the Bioinformatics Cartoon for this chapter, courtesy of <a href="http://bearandfox.com" target="_blank" title="Link: http://bearandfox.com">Randall Christopher</a> and serving as a chapter header in the Specialization's bestselling <a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">print companion</a>. How did the monkey lose a wine-drinking contest to a tiny mammal? Why have Pavel and Phillip become cavemen? And will flipping a coin help them escape their eternal boredom until they can return to the present? Start learning to find out!</p><p><img width="550" alt="" src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg" title="Image: http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/clustering_cropped.jpg"></p>
5 horas para concluir
5 vídeos (Total 33 mín.), 2 leituras, 3 testes
5 videos
Which Yeast Genes are Responsible for Wine Making? 6min
Gene Expression Matrices 6min
Clustering as an Optimization Problem 10min
The Lloyd Algorithm for k-Means Clustering 5min
2 leituras
Course Details10min
Week 1 FAQs (Optional)
1 exercício prático
Week 1 Quiz20min
4 horas para concluir
Week 2: Advanced Clustering Techniques
<p>Welcome to week 2 of class!</p>
4 horas para concluir
5 vídeos (Total 35 mín.), 1 leitura, 3 testes
5 videos
From Coin Flipping to k-Means Clustering 4min
Expectation Maximization 7min
Soft k-Means Clustering 3min
Hierarchical Clustering 7min
1 leituras
Week 2 FAQs (Optional)
1 exercício prático
Week 2 Quiz15min
1 hora para concluir
Week 3: Introductory Algorithms in Population Genetics
1 hora para concluir
2 leituras
2 leituras
Statement on This Week's Material10min
How Have Humans Populated the Earth?10min
1 exercício prático
Week 3 Quiz30min
Avaliações
Principais avaliações do CIÊNCIA E CLUSTERING DE DADOS GENÔMICOS (BIOINFORMÁTICA V)
por DD23 de Out de 2019
Truly awesome. What I liked best was that this course didn't have a peer reviewed final challenge, so I didn't have to wait months until my work was graded :)
por JM21 de Mar de 2020
Really enjoyed the clustering chapters and the practical exercises with the yeast dataset
por HW9 de Jun de 2017
the part about EM is the best I know, and first time I understand the EM algorithm.
por ZX20 de Jul de 2019
In depth and comprehensive coverage of the topics in genetic data analysis.
Sobre Programa de cursos integrados Bioinformática
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Perguntas Frequentes – FAQ
Quando terei acesso às palestras e às tarefas?
O que recebo ao me inscrever nesta Especialização?
Is financial aid available?
Mais dúvidas? Visite o Central de Ajuda ao Aprendiz.
