In previous courses in the Specialization, we have discussed how to sequence and compare genomes. This course will cover advanced topics in finding mutations lurking within DNA and proteins.
Este curso faz parte do Programa de cursos integrados Bioinformática
oferecido por
Programa de cursos integrados BioinformáticaUniversidade da Califórnia, San DiegoInformações sobre o curso
8,403 visualizações recentes
Certificados compartilháveis
Tenha o certificado após a conclusão
100% on-line
Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.
Curso 6 de 7 no
Prazos flexíveis
Redefinir os prazos de acordo com sua programação.
Nível iniciante
Aprox. 23 horas para completar
Inglês
Legendas: Inglês
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Nível iniciante
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Universidade da Califórnia, San Diego
UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory.
Programa - O que você aprenderá com este curso
4 horas para concluir
Week 1: Introduction to Read Mapping
<p>Welcome to our class! We are glad that you decided to join us.</p><p>In this class, we will consider the following two central biological questions (the computational approaches needed to solve them are shown in parentheses):</p><ol><li>How Do We Locate Disease-Causing Mutations? (<em>Combinatorial Pattern Matching</em>)</li><li>Why Have Biologists Still Not Developed an HIV Vaccine? (<em>Hidden Markov Models</em>)</li></ol><p>As in previous courses, each of these two chapters is accompanied by a Bioinformatics Cartoon created by talented artist Randall Christopher and serving as a chapter header in the Specialization's bestselling <a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">print companion</a>. You can find the first chapter's cartoon at the bottom of this message. </p><p><img src="https://stepic.org/media/attachments/lessons/292/chapter7_cropped.jpg" title="Image: https://stepic.org/media/attachments/lessons/292/chapter7_cropped.jpg" width="528"></p>
4 horas para concluir
4 vídeos (Total 33 mín.), 2 leituras, 3 testes
4 videos
Why Do We Map Reads? 7min
Using the Trie 10min
From a Trie to a Suffix Tree 11min
2 leituras
Course Details10min
Week 1 FAQs (Optional)
1 exercício prático
How Do We Find Disease-Causing Mutations? (Week 1)15min
4 horas para concluir
Week 2: The Burrows-Wheeler Transform
<p>Welcome to week 2 of the class!</p>
4 horas para concluir
3 vídeos (Total 21 mín.), 1 leitura, 2 testes
3 videos
Inverting Burrows-Wheeler 13min
Using Burrows-Wheeler for Pattern Matching 2min
1 leituras
Week 2 FAQs (Optional)
4 horas para concluir
Week 3: Speeding Up Burrows-Wheeler Read Mapping
<p>Welcome to week 3 of class!</p>
4 horas para concluir
4 vídeos (Total 22 mín.), 1 leitura, 3 testes
4 videos
Setting Up Checkpoints 8min
Inexact Matching 6min
Further Applications of Read Mapping 2min
1 leituras
Week 3 FAQs (Optional)
1 exercício prático
How Do We Find Disease-Causing Mutations? (Weeks 2-3)20min
4 horas para concluir
Week 4: Introduction to Hidden Markov Models
<p>Welcome to week 4 of class!</p>
4 horas para concluir
5 vídeos (Total 42 mín.)
5 videos
Gambling with Yakuza 12min
From a Crooked Casino to a Hidden Markov Model 9min
The Decoding Problem 5min
The Viterbi Algorithm 7min
Avaliações
Principais avaliações do DECIFRANDO MUTAÇÕES NO DNA E NAS PROTEÍNAS (BIOINFORMÁTICA VI)
por TK28 de Jun de 2016
One of the best specialization on Coursera. Highly recommended for anyone who wants to apply his/her programming skills to fascinating real-world problems.
por DC15 de Set de 2018
Really enjoyed this course. It was great to get to build on work from previous courses.
por RG13 de Abr de 2020
It was probably my favorite in this specialization (at least, out of first six).
por JM22 de Jun de 2020
Really loved learning about suffix trees/arrays, BWT, Pattern matching, HMMs!
Sobre Programa de cursos integrados Bioinformática
Join Us in a Top 50 MOOC of All Time!
How do we sequence and compare genomes? How do we identify the genetic basis for disease? How do we construct an evolutionary Tree of Life for all species on Earth?
When you complete this Specialization, you will learn how to answer many questions in modern biology that have become inseparable from the computational approaches used to solve them. You will also obtain a toolkit of existing software resources built on these computational approaches and that are used by thousands of biologists every day in one of the fastest growing fields in science.
Although this Specialization centers on computational topics, you do not need to know how to program in order to complete it. If you are interested in programming, we feature an "Honors Track" (called "hacker track" in previous runs of the course). The Honors Track allows you to implement the bioinformatics algorithms that you will encounter along the way in dozens of automatically graded coding challenges. By completing the Honors Track, you will be a bioinformatics software professional!
Learn more about the Bioinformatics Specialization (including why we are wearing these crazy outfits) by watching our introductory video.
You can purchase the Specialization's print companion, Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach, from the textbook website.
Our first course, "Finding Hidden Messages in DNA", was named a top-50 MOOC of all time by Class Central!
Perguntas Frequentes – FAQ
Quando terei acesso às palestras e às tarefas?
O acesso a palestras e tarefas depende do tipo de inscrição. Se você participar de um curso como ouvinte, você poderá ver quase todo o conteúdo do curso gratuitamente. Para acessar tarefas valendo nota e obter um Certificado, você precisará adquirir a experiência do Certificado, durante ou após a participação como ouvinte. Se você não vir a opção de participar como ouvinte:
- o curso pode não oferecer essa opção. Você pode experimentar um teste gratuito ou solicitar o auxílio financeiro.
- Em vez disso, o curso pode oferecer 'Curso completo, sem Certificado'. Com esta opção, é possível ver todo o conteúdo do curso, enviar as avaliações necessárias e obter uma nota final. Isso também significa que você não poderá comprar uma experiência de Certificado.
O que recebo ao me inscrever nesta Especialização?
Quando você se inscreve no curso, tem acesso a todos os cursos na Especialização e pode obter um certificado quando concluir o trabalho. Seu Certificado eletrônico será adicionado à sua página de Participações e você poderá imprimi-lo ou adicioná-lo ao seu perfil no LinkedIn. Se quiser apenas ler e assistir o conteúdo do curso, você poderá frequentá-lo como ouvinte sem custo.
Qual é a política de reembolso?
Se você se inscrever, terá 7 dias para testar sem custo e, durante este período, pode cancelar sem multa. Depois disso, não reembolsamos, mas você pode cancelar sua inscrição a qualquer momento. Veja nossa política para o reembolso total.
Existe algum auxílio financeiro disponível?
Sim, a Coursera oferece auxílio financeiro ao aluno que não possa pagar a taxa. Faça a solicitação clicando no link Auxílio Financeiro, abaixo do botão "Inscreva-se" à esquerda. Preencha uma solicitação e será notificado caso seja aprovado. Você terá que completar esta etapa para cada curso na Especialização, incluindo o Trabalho de Conclusão de Curso. Saiba mais .
Ganharei créditos universitários por concluir o curso?
Este curso não oferece créditos universitários, mas algumas universidades podem aceitar certificados de cursos que podem ser convertidos em créditos. Entre em contato com sua instituição para saber mais. Com os cursos on-line e os certificados Mastertrack™ do Coursera, é possível ganhar créditos universitários.
Mais dúvidas? Visite o Central de Ajuda ao Aprendiz.
