3D SARS-CoV-19 Protein Visualization With Biopython

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oferecido por
Coursera Project Network
Neste Projeto Guiado gratuito, você irá:

Biological sequence/ Data manipulation with Biopython

Query Biological Databases using Biopython & web-scraping

Create an interactive 3D model of SARS-CoV-19 Protein

Mostre essa experiência prática em uma entrevista

Clock2 hours
IntermediateIntermediário
CloudSem necessidade de download
VideoVídeo em tela dividida
Comment DotsInglês
LaptopApenas em desktop

In this project you will create an interactive three-dimensional (3D) representation of SARS-CoV-19 (Coronavirus) protein structures & publication-quality pictures of the same, understand properties of SARS-CoV-19 genome, handle biological sequence data stored in FASTA & PDB (Protein Data Bank) and XML format, and get insights from this data using Biopython. This hands-on project will also give you a glimpse of tasks a Bioinformatician performs on a daily basis, along with the up-to-date concepts and database use cases in the field of Medical Research and Human genetics. In this project, we will also cover basics about important databases used by biologists and biotechnologists, along with the type of sequence data we can access and visualize from these databases using Biopython & Jupyter notebook.

Habilidades que você desenvolverá

SARS-CoV-19BiopythonPython ProgrammingBioinformaticsBiotechnology

Aprender passo a passo

Em um vídeo reproduzido em uma tela dividida com a área de trabalho, seu instrutor o orientará sobre esses passos:

  1. Introduction to Biopython

  2. Understand FASTA file format

  3. Sequence manipulation using Biopython

  4. Transcription & Translation studies

  5. Perform Basic Local Alignment using NCBI-BLAST

  6. Reading PDB file

  7. Visualizing SARS-CoV-19 Protein structures

Como funcionam os projetos guiados

Sua área de trabalho é um espaço em nuvem, acessado diretamente do navegador, sem necessidade de nenhum download

Em um vídeo de tela dividida, seu instrutor te orientará passo a passo

Instrutores

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Perguntas Frequentes – FAQ

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