In this capstone project course, we'll compare genome sequences of COVID-19 mutations to identify potential areas a drug therapy can look to target. The first step in drug discovery involves identifying target subsequences of theirs genome to target. We'll start by comparing the genomes of virus mutations to look for similarities. Then, we'll perform PCA to cut down our number of dimensions and identify the most common features. Next, we'll use K-means clustering in Python to find the optimal number of groups and trace the lineage of the virus. Finally, we'll predict similarity between the sequences and use this to pick a target subsequence. Throughout the course, each section will consist of a programming assignment coupled with a guide video and helpful hints. By the end, you'll be well on your way to discovering ways to combat disease with genome sequencing.
Este curso faz parte do Programa de cursos integrados AI for Scientific Research
oferecido por
Informações sobre o curso
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Prazos flexíveis
Redefinir os prazos de acordo com sua programação.
Certificados compartilháveis
Tenha o certificado após a conclusão
100% on-line
Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.
Curso 4 de 4 no
Nível intermediário
We recoomend that you take the other two courses in the specizliation (or are familiar with the content) before attempting this capstone project.
Aprox. 12 horas para completar
Inglês
O que você vai aprender
Analyzing genome sequences to find similarities and identify target subsequences using predctive models.
Habilidades que você terá
- Whole Genome Sequencing
- Machine Learning
- Drug Discovery
- Dimensionality Reduction
- K-Means Clustering
Prazos flexíveis
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100% on-line
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Curso 4 de 4 no
Nível intermediário
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Aprox. 12 horas para completar
Inglês
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Programa - O que você aprenderá com este curso
3 horas para concluir
Comparing Genome Sequences
3 horas para concluir
4 vídeos (Total 7 mín.)
3 horas para concluir
Principal Component Analysis on Genome Sequences
3 horas para concluir
2 vídeos (Total 3 mín.), 1 leitura, 1 teste
3 horas para concluir
Feature Analysis using K-Means Clustering
3 horas para concluir
2 vídeos (Total 2 mín.)
3 horas para concluir
Predicting Bit Score to Find Sequence Matches
3 horas para concluir
2 vídeos (Total 3 mín.)
Sobre Programa de cursos integrados AI for Scientific Research
Perguntas Frequentes – FAQ
Quando terei acesso às palestras e às tarefas?
O que recebo ao me inscrever nesta Especialização?
Existe algum auxílio financeiro disponível?
Mais dúvidas? Visite o Central de Ajuda ao estudante.
