Курс «Введение в биоинформатику» адресован тем, кто хочет получить расширенное представление о том, что такое биоинформатика и как она помогает биологам и медикам в их работе.
oferecido por
Введение в биоинформатику (Introdução à Bioinformática)
Universidade Estadual de São PetersburgoUniversidade Estadual de São PetersburgoInformações sobre o curso
17,749 visualizações recentes
Certificados compartilháveis
Tenha o certificado após a conclusão
100% on-line
Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.
Prazos flexíveis
Redefinir os prazos de acordo com sua programação.
Nível iniciante
Aprox. 11 horas para completar
Russo
Legendas: Russo
Instrutores
Certificados compartilháveis
Tenha o certificado após a conclusão
100% on-line
Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.
Prazos flexíveis
Redefinir os prazos de acordo com sua programação.
Nível iniciante
Aprox. 11 horas para completar
Russo
Legendas: Russo
oferecido por
Universidade Estadual de São PetersburgoUniversidade Estadual de São Petersburgo
Санкт-Петербургский государственный университет (СПбГУ) — старейший вуз России, основанный в 1724 году. Университет сегодня — научный, образовательный и культурный центр мирового значения, неизменно входящий во все международные рейтинги вузов. В номинации взаимодействие с работодателями QS Graduate Employability 2018 СПбГУ занимает 20 место среди 400 ведущих вузов мира и является лучшим в России.
Programa - O que você aprenderá com este curso
2 horas para concluir
Неделя 1 - Введение (Week 1 - Introducton)
Первая неделя нашего курса посвящена основным концепциям геномной биоинформатики. Вы узнаете об истории этой дисциплины, основных методах и алгоритмах. Также вас ждет знакомство с реальной лабораторной работой - мы расскажем, как выделяется ДНК и откуда берутся данные, с которыми нам предстоит работать в дальнейшем. <br>The first week of our course covers the basic concepts of genome bioinformatics. You will learn about the history of this discipline, the main methods and algorithms. Also you will familiarize yourself with actual laboratory work - we will explain how DNA is extracted and where the sequencing data comes from.
2 horas para concluir
8 vídeos (Total 61 mín.)
8 videos
Сиквенсные проекты (Sequencing Projects)3min
Алгоритмы сборки (Assembly Algorithms)6min
Подходы к анализу данных (Data Analysis Approaches)6min
Знакомство с методами выделения геномной ДНК (Genomic DNA Isolation techniques overview) (13:49)13min
Определение количества и качества ДНК (DNA quality and quantity control) (07:37)7min
Подготовка ДНК-библиотек для секвенатора Illumina MiSeq (DNA-library preparation for Illumina MiSeq platform) (13:21)13min
Запуск секвенатора Illumina MiSeq (Illumina MiSeq sequencer running) (03:25)3min
1 exercício prático
Тест 1 (Quiz 1)30min
1 hora para concluir
Неделя 2 - Технологии секвенирования (Sequencing Technologies)
Добро пожаловать на вторую неделю нашего курса! Эта неделя будет посвящена обзору методов секвенирования ДНК. Вы узнаете об истории развития этих технологий и принципах, на которых они основаны. <br>Welcome to the second week of the course! This week will be dedicated to Next Generation DNA Sequencing technologies. You will learn about the new methods development and main approaches that gave base to NGS.
1 hora para concluir
4 vídeos (Total 41 mín.)
4 videos
Обзор технологий нового поколения (NGS Technologies Overview)7min
454, Ion Torrent, SOLiD, Illumina14min
Synthetic Long Reads, PacBio, Oxford Nanopore9min
1 exercício prático
Тест 2 (Quiz 2)30min
1 hora para concluir
Неделя 3 - Контроль качества (Quality Control)
На этой неделе вы уже можете приступить к работе над геномным проектом. В лекциях мы поговорим о формате представления исходных данных и контроле качества. Также мы подготовили для вас небольшое введение в операционную систему Linux, так как большинство необходимых нам программ разработаны именно для нее. <br>This week your can start working on the real genome project. This week lectures will cover raw data formats and aspects of quality control. Also we offer you a brief introduction to the Linux, because the majority of bioinformatics tools developed for this operation system.
1 hora para concluir
6 vídeos (Total 50 mín.)
6 videos
Форматы данных, шкала Phred (Data Formats, Phred Scale)4min
Проверка качества. FastQC (Quality Check. FastQC)10min
Пример - часть 1 (Case Study - part 1)9min
Пример - часть 2 (Case Study - part 2)8min
Введение в Linux (Introduction to Linux)13min
1 exercício prático
Тест 3 (Quiz 3)30min
2 horas para concluir
Неделя 4 - Сборка ДНК de novo (De novo DNA assembly)
Добро пожаловать на четвертую неделю нашего курса. Она будет посвящена сборке геномов de novo. Вы узнаете о различных подходах к секвенированию малоизученных организмов, и о проблемах, которые при этом возникают. Также мы расскажем о работе алгоримов, используемых при сборке новых геномов. Оставайтесь с нами! <br>Welcome to the fourth week of our course. It will be dedicated to de novo genome assembly. You will hear about different sequencing approaches of unknown organisms, and the problems associated with this task. We will also talk about algorithms used for the assembly of new genomes. Stay tuned!
2 horas para concluir
7 vídeos (Total 72 mín.)
7 videos
Сборка ДНК de novo - часть 2 (De novo DNA assembly - part 2)15min
Алгоритмы (Algorithms)6min
Сложность алгоритмов (Algorithms Complexity)9min
Overlap Layout Concensus9min
Графы де Брюйна (De Bruijn Graphs)8min
Алгоритмы сборки геномов (Genome Assembly Algorithms)10min
1 exercício prático
Тест 4 (Quiz 4)30min
Perguntas Frequentes – FAQ
Quando terei acesso às palestras e às tarefas?
O acesso a palestras e tarefas depende do tipo de inscrição. Se você participar de um curso como ouvinte, você poderá ver quase todo o conteúdo do curso gratuitamente. Para acessar tarefas valendo nota e obter um Certificado, você precisará adquirir a experiência do Certificado, durante ou após a participação como ouvinte. Se você não vir a opção de participar como ouvinte:
- o curso pode não oferecer essa opção. Você pode experimentar um teste gratuito ou solicitar o auxílio financeiro.
- Em vez disso, o curso pode oferecer 'Curso completo, sem Certificado'. Com esta opção, é possível ver todo o conteúdo do curso, enviar as avaliações necessárias e obter uma nota final. Isso também significa que você não poderá comprar uma experiência de Certificado.
O que recebo ao adquirir o Certificado?
Quando você adquire o Certificado, ganha acesso a todo o material do curso, incluindo avaliações com nota atribuída. Após concluir o curso, seu Certificado eletrônico será adicionado à sua página de Participações e você poderá imprimi-lo ou adicioná-lo ao seu perfil no LinkedIn. Se quiser apenas ler e assistir o conteúdo do curso, você poderá frequentá-lo como ouvinte sem custo.
Is financial aid available?
Sim, a Coursera oferece auxílio financeiro aos alunos que não podem pagar a taxa. Faça a solicitação clicando no link Auxílio financeiro, abaixo do botão "Inscreva-se" à esquerda. Você será solicitado a preencher um formulário e será notificado se for aprovado. Saiba mais.
Mais dúvidas? Visite o Central de Ajuda ao Aprendiz.
