Курс «Введение в биоинформатику» адресован тем, кто хочет получить расширенное представление о том, что такое биоинформатика и как она помогает биологам и медикам в их работе.
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Введение в биоинформатику (Introdução à Bioinformática)
Universidade Estadual de São PetersburgoUniversidade Estadual de São PetersburgoInformações sobre o curso
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Certificados compartilháveis
Tenha o certificado após a conclusão
100% on-line
Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.
Prazos flexíveis
Redefinir os prazos de acordo com sua programação.
Nível iniciante
Aprox. 11 horas para completar
Russo
Legendas: Russo
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Universidade Estadual de São PetersburgoUniversidade Estadual de São Petersburgo
Санкт-Петербургский государственный университет (СПбГУ) — старейший вуз России, основанный в 1724 году. Университет сегодня — научный, образовательный и культурный центр мирового значения, неизменно входящий во все международные рейтинги вузов. В номинации взаимодействие с работодателями QS Graduate Employability 2018 СПбГУ занимает 20 место среди 400 ведущих вузов мира и является лучшим в России.
Programa - O que você aprenderá com este curso
2 horas para concluir
Неделя 1 - Введение (Week 1 - Introducton)
Первая неделя нашего курса посвящена основным концепциям геномной биоинформатики. Вы узнаете об истории этой дисциплины, основных методах и алгоритмах. Также вас ждет знакомство с реальной лабораторной работой - мы расскажем, как выделяется ДНК и откуда берутся данные, с которыми нам предстоит работать в дальнейшем. <br>The first week of our course covers the basic concepts of genome bioinformatics. You will learn about the history of this discipline, the main methods and algorithms. Also you will familiarize yourself with actual laboratory work - we will explain how DNA is extracted and where the sequencing data comes from.
2 horas para concluir
8 vídeos (Total 61 mín.)
8 videos
Сиквенсные проекты (Sequencing Projects)3min
Алгоритмы сборки (Assembly Algorithms)6min
Подходы к анализу данных (Data Analysis Approaches)6min
Знакомство с методами выделения геномной ДНК (Genomic DNA Isolation techniques overview) (13:49)13min
Определение количества и качества ДНК (DNA quality and quantity control) (07:37)7min
Подготовка ДНК-библиотек для секвенатора Illumina MiSeq (DNA-library preparation for Illumina MiSeq platform) (13:21)13min
Запуск секвенатора Illumina MiSeq (Illumina MiSeq sequencer running) (03:25)3min
1 exercício prático
Тест 1 (Quiz 1)30min
1 hora para concluir
Неделя 2 - Технологии секвенирования (Sequencing Technologies)
Добро пожаловать на вторую неделю нашего курса! Эта неделя будет посвящена обзору методов секвенирования ДНК. Вы узнаете об истории развития этих технологий и принципах, на которых они основаны. <br>Welcome to the second week of the course! This week will be dedicated to Next Generation DNA Sequencing technologies. You will learn about the new methods development and main approaches that gave base to NGS.
1 hora para concluir
4 vídeos (Total 41 mín.)
4 videos
Обзор технологий нового поколения (NGS Technologies Overview)7min
454, Ion Torrent, SOLiD, Illumina14min
Synthetic Long Reads, PacBio, Oxford Nanopore9min
1 exercício prático
Тест 2 (Quiz 2)30min
1 hora para concluir
Неделя 3 - Контроль качества (Quality Control)
На этой неделе вы уже можете приступить к работе над геномным проектом. В лекциях мы поговорим о формате представления исходных данных и контроле качества. Также мы подготовили для вас небольшое введение в операционную систему Linux, так как большинство необходимых нам программ разработаны именно для нее. <br>This week your can start working on the real genome project. This week lectures will cover raw data formats and aspects of quality control. Also we offer you a brief introduction to the Linux, because the majority of bioinformatics tools developed for this operation system.
1 hora para concluir
6 vídeos (Total 50 mín.)
6 videos
Форматы данных, шкала Phred (Data Formats, Phred Scale)4min
Проверка качества. FastQC (Quality Check. FastQC)10min
Пример - часть 1 (Case Study - part 1)9min
Пример - часть 2 (Case Study - part 2)8min
Введение в Linux (Introduction to Linux)13min
1 exercício prático
Тест 3 (Quiz 3)30min
2 horas para concluir
Неделя 4 - Сборка ДНК de novo (De novo DNA assembly)
Добро пожаловать на четвертую неделю нашего курса. Она будет посвящена сборке геномов de novo. Вы узнаете о различных подходах к секвенированию малоизученных организмов, и о проблемах, которые при этом возникают. Также мы расскажем о работе алгоримов, используемых при сборке новых геномов. Оставайтесь с нами! <br>Welcome to the fourth week of our course. It will be dedicated to de novo genome assembly. You will hear about different sequencing approaches of unknown organisms, and the problems associated with this task. We will also talk about algorithms used for the assembly of new genomes. Stay tuned!
2 horas para concluir
7 vídeos (Total 72 mín.)
7 videos
Сборка ДНК de novo - часть 2 (De novo DNA assembly - part 2)15min
Алгоритмы (Algorithms)6min
Сложность алгоритмов (Algorithms Complexity)9min
Overlap Layout Concensus9min
Графы де Брюйна (De Bruijn Graphs)8min
Алгоритмы сборки геномов (Genome Assembly Algorithms)10min
1 exercício prático
Тест 4 (Quiz 4)30min
Perguntas Frequentes – FAQ
Quando terei acesso às palestras e às tarefas?
Ao se inscrever para um Certificado, você terá acesso a todos os vídeos, testes e tarefas de programação (se aplicável). Tarefas avaliadas pelos colegas apenas podem ser enviadas e avaliadas após o início da sessão. Caso escolha explorar o curso sem adquiri-lo, talvez você não consiga acessar certas tarefas.
O que recebo ao adquirir o Certificado?
Quando você adquire o Certificado, ganha acesso a todo o material do curso, incluindo avaliações com nota atribuída. Após concluir o curso, seu Certificado eletrônico será adicionado à sua página de Participações e você poderá imprimi-lo ou adicioná-lo ao seu perfil no LinkedIn. Se quiser apenas ler e assistir o conteúdo do curso, você poderá frequentá-lo como ouvinte sem custo.
Qual é a política de reembolso?
Você poderá pedir reembolso total até duas semanas após a data do pagamento, ou (para cursos recém-iniciados) até duas semanas após o início da primeira sessão do curso, o que ocorrer por último. Você não poderá receber reembolso após obter o Certificado de Curso, mesmo que tenha completado o curso dentro do período de duas semanas. Veja nossa política para o reembolso total.
Existe algum auxílio financeiro disponível?
Sim, a Coursera oferece auxílio financeiro aos alunos que não podem pagar a taxa. Faça a solicitação clicando no link Auxílio financeiro, abaixo do botão "Inscreva-se" à esquerda. Você será solicitado a preencher um formulário e será notificado se for aprovado. Saiba mais.
Ganharei créditos universitários por concluir o curso?
Este curso não oferece créditos universitários, mas algumas universidades podem aceitar certificados de cursos que podem ser convertidos em créditos. Entre em contato com sua instituição para saber mais. Com os cursos on-line e os certificados Mastertrack™ do Coursera, é possível ganhar créditos universitários.
Mais dúvidas? Visite o Central de Ajuda ao Aprendiz.