Informações sobre o curso
4.6
49 classificações
6 avaliações
100% online

100% online

Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.
Prazos flexíveis

Prazos flexíveis

Redefinir os prazos de acordo com sua programação.
Nível iniciante

Nível iniciante

Horas para completar

Aprox. 24 horas para completar

Sugerido: 6 hours/week...
Idiomas disponíveis

Russo

Legendas: Russo
100% online

100% online

Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.
Prazos flexíveis

Prazos flexíveis

Redefinir os prazos de acordo com sua programação.
Nível iniciante

Nível iniciante

Horas para completar

Aprox. 24 horas para completar

Sugerido: 6 hours/week...
Idiomas disponíveis

Russo

Legendas: Russo

Programa - O que você aprenderá com este curso

Semana
1
Horas para completar
1 hora para concluir

Неделя 1 - Введение (Week 1 - Introducton)

Первая неделя нашего курса посвящена основным концепциям геномной биоинформатики. Вы узнаете об истории этой дисциплины, основных методах и алгоритмах. Также вас ждет знакомство с реальной лабораторной работой - мы расскажем, как выделяется ДНК и откуда берутся данные, с которыми нам предстоит работать в дальнейшем. <br>The first week of our course covers the basic concepts of genome bioinformatics. You will learn about the history of this discipline, the main methods and algorithms. Also you will familiarize yourself with actual laboratory work - we will explain how DNA is extracted and where the sequencing data comes from....
Reading
8 videos (Total 61 min), 1 teste
Video8 videos
Сиквенсные проекты (Sequencing Projects)3min
Алгоритмы сборки (Assembly Algorithms)6min
Подходы к анализу данных (Data Analysis Approaches)6min
Знакомство с методами выделения геномной ДНК (Genomic DNA Isolation techniques overview) (13:49)13min
Определение количества и качества ДНК (DNA quality and quantity control) (07:37)7min
Подготовка ДНК-библиотек для секвенатора Illumina MiSeq (DNA-library preparation for Illumina MiSeq platform) (13:21)13min
Запуск секвенатора Illumina MiSeq (Illumina MiSeq sequencer running) (03:25)3min
Quiz1 exercício prático
Тест 1 (Quiz 1)20min
Semana
2
Horas para completar
1 hora para concluir

Неделя 2 - Технологии секвенирования (Sequencing Technologies)

Добро пожаловать на вторую неделю нашего курса! Эта неделя будет посвящена обзору методов секвенирования ДНК. Вы узнаете об истории развития этих технологий и принципах, на которых они основаны. <br>Welcome to the second week of the course! This week will be dedicated to Next Generation DNA Sequencing technologies. You will learn about the new methods development and main approaches that gave base to NGS....
Reading
4 videos (Total 41 min), 1 teste
Video4 videos
Обзор технологий нового поколения (NGS Technologies Overview)7min
454, Ion Torrent, SOLiD, Illumina14min
Synthetic Long Reads, PacBio, Oxford Nanopore9min
Quiz1 exercício prático
Тест 2 (Quiz 2)20min
Semana
3
Horas para completar
1 hora para concluir

Неделя 3 - Контроль качества (Quality Control)

На этой неделе вы уже можете приступить к работе над геномным проектом. В лекциях мы поговорим о формате представления исходных данных и контроле качества. Также мы подготовили для вас небольшое введение в операционную систему Linux, так как большинство необходимых нам программ разработаны именно для нее. <br>This week your can start working on the real genome project. This week lectures will cover raw data formats and aspects of quality control. Also we offer you a brief introduction to the Linux, because the majority of bioinformatics tools developed for this operation system....
Reading
6 videos (Total 50 min), 1 teste
Video6 videos
Форматы данных, шкала Phred (Data Formats, Phred Scale)4min
Проверка качества. FastQC (Quality Check. FastQC)10min
Пример - часть 1 (Case Study - part 1)9min
Пример - часть 2 (Case Study - part 2)8min
Введение в Linux (Introduction to Linux)13min
Quiz1 exercício prático
Тест 3 (Quiz 3)20min
Semana
4
Horas para completar
2 horas para concluir

Неделя 4 - Сборка ДНК de novo (De novo DNA assembly)

Добро пожаловать на четвертую неделю нашего курса. Она будет посвящена сборке геномов de novo. Вы узнаете о различных подходах к секвенированию малоизученных организмов, и о проблемах, которые при этом возникают. Также мы расскажем о работе алгоримов, используемых при сборке новых геномов. Оставайтесь с нами! <br>Welcome to the fourth week of our course. It will be dedicated to de novo genome assembly. You will hear about different sequencing approaches of unknown organisms, and the problems associated with this task. We will also talk about algorithms used for the assembly of new genomes. Stay tuned!...
Reading
7 videos (Total 72 min), 1 teste
Video7 videos
Сборка ДНК de novo - часть 2 (De novo DNA assembly - part 2)15min
Алгоритмы (Algorithms)6min
Сложность алгоритмов (Algorithms Complexity)9min
Overlap Layout Concensus9min
Графы де Брюйна (De Bruijn Graphs)8min
Алгоритмы сборки геномов (Genome Assembly Algorithms)10min
Quiz1 exercício prático
Тест 4 (Quiz 4)20min

Instrutores

Avatar

Alla L Lapidus

Professor, Department of Cytology and Histology
Centre For Algorithmic Biotechnology
Avatar

Павел Добрынин

Младший научный сотрудник
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского
Avatar

Михаил Райко

Постдок
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского
Avatar

Екатерина Черняева

Постдок
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского

Sobre Saint Petersburg State University

The Saint-Petersburg University (SPbU) is a state university, located in Saint-Petersburg, Russia. Founded in 1724, SPbU is the oldest institution of higher education in Russia. At present, there are more than 30 000 students in SPbU studying 398 programmes...

Perguntas Frequentes – FAQ

  • Ao se inscrever para um Certificado, você terá acesso a todos os vídeos, testes e tarefas de programação (se aplicável). Tarefas avaliadas pelos colegas apenas podem ser enviadas e avaliadas após o início da sessão. Caso escolha explorar o curso sem adquiri-lo, talvez você não consiga acessar certas tarefas.

  • Quando você adquire o Certificado, ganha acesso a todo o material do curso, incluindo avaliações com nota atribuída. Após concluir o curso, seu Certificado eletrônico será adicionado à sua página de Participações e você poderá imprimi-lo ou adicioná-lo ao seu perfil no LinkedIn. Se quiser apenas ler e assistir o conteúdo do curso, você poderá frequentá-lo como ouvinte sem custo.

Mais dúvidas? Visite o Central de Ajuda ao Aprendiz.