Este curso faz parte do Programa de cursos integrados Bioinformática

4.1
estrelas
19 classificações
•
6 avaliações

Phillip Compeau +1 mais instrutores

3.953 já se inscreveram

oferecido por

Programa de cursos integrados BioinformáticaUniversidade da Califórnia, San Diego

Informações sobre o curso

2.217 visualizações recentes

In this course, you will learn how to use the BaseSpace cloud platform developed by Illumina (our industry partner) to apply several standard bioinformatics software approaches to real biological data.
In particular, in a series of Application Challenges will see how genome assembly can be used to track the source of a food poisoning outbreak, how RNA-Sequencing can help us analyze gene expression data on the tissue level, and compare the pros and cons of whole genome vs. whole exome sequencing for finding potentially harmful mutations in a human sample.

Plus, hacker track students will have the option to build their own genome assembler and apply it to real data!

Prazos flexíveis

Redefinir os prazos de acordo com sua programação.

Certificados compartilháveis

Tenha o certificado após a conclusão

100% on-line

Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.

Curso 7 de 7 no

Programa de cursos integrados Bioinformática

Nível iniciante

Aprox. 14 horas para completar

Inglês

Legendas: Inglês

Instrutores

Phillip Compeau

Visiting Researcher

Department of Computer Science & Engineering

188.419 aprendizes

8 Cursos

Pavel Pevzner

Professor

Department of Computer Science and Engineering

587.989 aprendizes

14 Cursos

Prazos flexíveis

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Certificados compartilháveis

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Curso 7 de 7 no

Programa de cursos integrados Bioinformática

Nível iniciante

Aprox. 14 horas para completar

Inglês

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oferecido por

Universidade da Califórnia, San Diego

UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory.

Programa - O que você aprenderá com este curso

Semana

Semana 1

5 horas para concluir

Week 1: Identifying the Culprit in a Food Poisoning Outbreak

This week, we will apply genome sequencing algorithms to identify the bacterium causing a deadly food poisoning outbreak.

5 horas para concluir

5 leituras

Semana

Semana 2

4 horas para concluir

Week 2: Comparing Gene Expression in Tissue Samples with RNA-Seq

In this week's Application Challenge, we will learn how RNA-Sequencing can be applied to perform tissue-level gene expression analysis. In particular, which is more similar on a gene expression level: different tissues from the same organism, or analogous tissues from related species? This question was the subject of recent debate and a Twitter controversy -- read more to find out!

4 horas para concluir

2 leituras

Semana

Semana 3

5 horas para concluir

Week 3: Weighing the Pros and Cons of Whole Genome and Whole Exome Sequencing on a Human Sample

Comparing the differences between sequencing an entire human genome and sequencing only the exome, or the DNA that is eventually translated into protein. Can we obtain a complete picture of someone's genetic disease predispositions from only the exome, or is there information lurking in introns that can provide doctors with vital information? How do we weigh the trade-offs when considering genome and exome sequencing?

5 horas para concluir

4 leituras

Avaliações

4.1

6 avaliações

5 stars
63,15%
4 stars
15,78%
3 stars
5,26%
1 star
15,78%

Principais avaliações do BIOINFORMATICS CAPSTONE: BIG DATA IN BIOLOGY

por KA3 de Set de 2019

I hope that the links to access data in the peer graded assignments gets fixed soon!

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Sobre Programa de cursos integrados Bioinformática

Join Us in a Top 50 MOOC of All Time!

How do we sequence and compare genomes? How do we identify the genetic basis for disease? How do we construct an evolutionary Tree of Life for all species on Earth? When you complete this Specialization, you will learn how to answer many questions in modern biology that have become inseparable from the computational approaches used to solve them. You will also obtain a toolkit of existing software resources built on these computational approaches and that are used by thousands of biologists every day in one of the fastest growing fields in science. Although this Specialization centers on computational topics, you do not need to know how to program in order to complete it. If you are interested in programming, we feature an "Honors Track" (called "hacker track" in previous runs of the course). The Honors Track allows you to implement the bioinformatics algorithms that you will encounter along the way in dozens of automatically graded coding challenges. By completing the Honors Track, you will be a bioinformatics software professional! Learn more about the Bioinformatics Specialization (including why we are wearing these crazy outfits) by watching our introductory video. You can purchase the Specialization's print companion, Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach, from the textbook website. Our first course, "Finding Hidden Messages in DNA", was named a top-50 MOOC of all time by Class Central!

Perguntas Frequentes – FAQ

Quando terei acesso às palestras e às tarefas?
O acesso a palestras e tarefas depende do tipo de inscrição. Se você participar de um curso como ouvinte, você poderá ver quase todo o conteúdo do curso gratuitamente. Para acessar tarefas valendo nota e obter um Certificado, você precisará adquirir a experiência do Certificado, durante ou após a participação como ouvinte. Se você não vir a opção de participar como ouvinte:
o curso pode não oferecer essa opção. Você pode experimentar um teste gratuito ou solicitar o auxílio financeiro.
Em vez disso, o curso pode oferecer 'Curso completo, sem Certificado'. Com esta opção, é possível ver todo o conteúdo do curso, enviar as avaliações necessárias e obter uma nota final. Isso também significa que você não poderá comprar uma experiência de Certificado.
O que recebo ao me inscrever nesta Especialização?
Quando você se inscreve no curso, tem acesso a todos os cursos na Especialização e pode obter um certificado quando concluir o trabalho. Seu Certificado eletrônico será adicionado à sua página de Participações e você poderá imprimi-lo ou adicioná-lo ao seu perfil no LinkedIn. Se quiser apenas ler e assistir o conteúdo do curso, você poderá frequentá-lo como ouvinte sem custo.
Existe algum auxílio financeiro disponível?
Sim, a Coursera oferece auxílio financeiro ao aluno que não possa pagar a taxa. Faça a solicitação clicando no link Auxílio Financeiro, abaixo do botão "Inscreva-se" à esquerda. Preencha uma solicitação e será notificado caso seja aprovado. Você terá que completar esta etapa para cada curso na Especialização, incluindo o Trabalho de Conclusão de Curso. Saiba mais .

Mais dúvidas? Visite o Central de Ajuda ao Aprendiz.

Bioinformatics Capstone: Big Data in Biology

Informações sobre o curso