Informações sobre o curso
4.7
181 classificações
36 avaliações
100% online

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Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.
Prazos flexíveis

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Redefinir os prazos de acordo com sua programação.
Nível iniciante

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Horas para completar

Aprox. 11 horas para completar

Sugerido: 12-18 hours of videos and labs...
Idiomas disponíveis

Inglês

Legendas: Inglês
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Programa - O que você aprenderá com este curso

Semana
1
Horas para completar
3 horas para concluir

Protein Motifs

In this module we'll be exploring conserved regions within protein families. Such regions can help us understand the biology of a sequence, in that they are likely important for biological function, and also be used to help ascribe function to sequences where we can't identify any homologs in the databases. There are various ways of describing the conserved regions from simple regular expressions to profiles to profile hidden Markov models (HMMs)....
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4 videos (Total 34 min), 4 leituras, 1 teste
Video4 videos
Lecture21min
Lab Discussion9min
Summary1min
Reading4 leituras
Acknowledgements10min
Course Logistics10min
Lecture Materials10min
Lab 1 -- Protein Domain, Motif and Profile Analysis30min
Quiz1 exercício prático
Lab 1 Quiz6min
Semana
2
Horas para completar
2 horas para concluir

Protein-Protein Interactions

In this module we'll be exploring protein-protein interactions (PPIs). Protein-protein interactions are important as proteins don't act in isolation, and often an examination of the interaction partners (determined in an unbiased, perhaps high throughput way) of a given protein can tell us a lot about its biology. We'll talk about some different methods used to determine PPIs and go over their strengths and weaknesses. In the lab we'll use 3 different tools and two different databases to examine interaction partners of BRCA2, a protein that we examined in last module's lab. Finally, we'll touch on a "foundational" concept, Gene Ontology (GO) term enrichment analysis, to help us understand in an overview way the proteins interacting with our example....
Reading
4 videos (Total 37 min), 2 leituras, 1 teste
Video4 videos
Lecture23min
Lab Discussion11min
Summary1min
Reading2 leituras
Lecture Materials10min
Lab 2 -- Protein-Protein Interactions30min
Quiz1 exercício prático
Lab 2 Quiz6min
Semana
3
Horas para completar
2 horas para concluir

Protein Structure

The determination of a protein's tertiary structure in three dimensions can tell us a lot about the biology of that protein. In this module's mini-lecture, we'll talk about some different methods used to determine a protein's tertiary structure and cover the main database for protein structure data, the PDB. In the lab we'll explore the PDB and an online tool for searching for structural (as opposed to sequence) similarity, VAST. We'll then use a nice piece of stand-alone software, PyMOL, to explore several protein structures in more detail....
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4 videos (Total 32 min), 2 leituras, 1 teste
Video4 videos
Lecture13min
Lab Discussion16min
Summary1min
Reading2 leituras
Lecture Materials10min
Lab 3 -- Structural Bioinformatics30min
Quiz1 exercício prático
Lab 3 Quiz6min
Semana
4
Horas para completar
10 minutos para concluir

Review: Protein Motifs, Protein-Protein Interactions, and Protein Structure

...
Reading
1 teste
Quiz1 exercício prático
Quiz: Protein Motifs, Protein-Protein Interactions, and Protein Structure10min
4.7
36 avaliaçõesChevron Right
Direcionamento de carreira

25%

comecei uma nova carreira após concluir estes cursos
Benefício de carreira

83%

consegui um benefício significativo de carreira com este curso
Promoção de carreira

12%

recebi um aumento ou promoção

Melhores avaliações

por RGApr 6th 2017

Gives the student real world exposure to the tools to study proteins gene regulation, etc. Instructor is involved and friendly. Highly recommended for someone who is interested in contemporary

por NMJan 9th 2018

Hi Nicholas, Thank you so much for giving a lot of information. Bioinformatic Methods II was little difficult but understood after repeating the lad discussions. Thanks a lot.

Instrutores

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Nicholas James Provart

Professor
Cell & Systems Biology

Sobre University of Toronto

Established in 1827, the University of Toronto is one of the world’s leading universities, renowned for its excellence in teaching, research, innovation and entrepreneurship, as well as its impact on economic prosperity and social well-being around the globe. ...

Perguntas Frequentes – FAQ

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