Large-scale biology projects such as the sequencing of the human genome and gene expression surveys using RNA-seq, microarrays and other technologies have created a wealth of data for biologists. However, the challenge facing scientists is analyzing and even accessing these data to extract useful information pertaining to the system being studied. This course focuses on employing existing bioinformatic resources – mainly web-based programs and databases – to access the wealth of data to answer questions relevant to the average biologist, and is highly hands-on.
Este curso faz parte do Programa de cursos integrados Plant Bioinformatic Methods
oferecido por
Programa de cursos integrados Plant Bioinformatic MethodsUniversidade de TorontoInformações sobre o curso
114,925 visualizações recentes
Resultados de carreira do aprendiz
24%
comecei uma nova carreira após concluir estes cursos
30%
consegui um benefício significativo de carreira com este curso
17%
recebi um aumento ou promoção
Certificados compartilháveis
Tenha o certificado após a conclusão
100% on-line
Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.
Curso 1 de 4 no
Prazos flexíveis
Redefinir os prazos de acordo com sua programação.
Nível iniciante
Aprox. 20 horas para completar
Inglês
Legendas: Inglês
Habilidades que você terá
Genetic AnalysisBioinformatics AnalysisEvolutionComparative Genomics
Resultados de carreira do aprendiz
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30%
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17%
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Nível iniciante
Aprox. 20 horas para completar
Inglês
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Universidade de Toronto
Established in 1827, the University of Toronto is one of the world’s leading universities, renowned for its excellence in teaching, research, innovation and entrepreneurship, as well as its impact on economic prosperity and social well-being around the globe.
Programa - O que você aprenderá com este curso
3 horas para concluir
NCBI/Blast I
In this module we'll be exploring the amazing resources available at NCBI, the National Centre for Biotechnology Information, run by the National Library of Medicine in the USA. We'll also be doing a Blast search to find similar sequences in the enormous NR sequence database. We can use similar sequences to infer homology, which is the primary predictor of gene or protein function.
3 horas para concluir
4 vídeos (Total 51 mín.), 4 leituras, 1 teste
4 leituras
Acknowledgements10min
Course Logistics10min
Lecture Materials10min
Lab 1 -- Exploring NCBI1h 30min
1 exercício prático
Lab 1 Quiz30min
3 horas para concluir
Blast II/Comparative Genomics
In this module we'll continue exploring the incredible resources available at NCBI, the National Centre for Biotechnology Information. We will be performing several different kinds of Blast searches: BlastP, PSI-Blast, and Translated Blast. We can use similar sequences identified by such methods to infer homology, which is the primary predictor of gene or protein function. We'll also be comparing parts of the genomes of a couple of different species, to see how similar they are.
3 horas para concluir
4 vídeos (Total 58 mín.), 2 leituras, 1 teste
2 leituras
Lecture Materials10min
Lab 2 -- Advanced Blast and Comparative Genomics1h 30min
1 exercício prático
Lab 2 Quiz30min
3 horas para concluir
Multiple Sequence Alignments
In this module we'll be doing multiple sequence alignments with Clustal (as implemented in MEGA), DiAlign, and MAFFT. Multiple sequences alignments can tell you where in a sequence the conserved and variable regions are, which is important for understanding the biology of the sequences under investigation. It also has practical applications, such as being able to design PCR primers that will amplify sequences from a number of different species, for example.
3 horas para concluir
4 vídeos (Total 44 mín.), 2 leituras, 1 teste
2 leituras
Lecture Materials10min
Lab 3 -- Multiple Sequence Alignment1h 30min
1 exercício prático
Lab 3 Quiz30min
1 hora para concluir
Review: NCBI/Blast I, Blast II/Comparative Genetics, and Multiple Sequence Alignments
1 hora para concluir
1 exercício prático
Quiz: Modules 1-330min
Avaliações
Principais avaliações do MÉTODOS DE BIOINFORMÁTICA I
por SA11 de Jul de 2020
This course is very well organized, easy to understand, and explained everything steps by step which will help to grasp the concept easily. If you are a beginner like me, you should take this course.
por ED26 de Abr de 2017
Great course. All lectures provide a biological context for the tools you learn in the labs. The labs themselves provide a great introduction to the many tools available for bioinformatic analysis.
por FJ5 de Fev de 2017
The videos were very clear on how to use various bioinformatic tools. I found no difficulty in understanding them. Really enjoyed the course. Looking forward to the next part of this course!
por RG4 de Nov de 2017
I enjoyed doing the course. It is exciting to see how much one can learn from a few gene or protein sequences. Thank you for making the course understandable to a beginner in bioinformatics!
Sobre Programa de cursos integrados Plant Bioinformatic Methods
The past 15 years have been exciting ones in plant biology. Hundreds of plant genomes have been sequenced, RNA-seq has enabled transcriptome-wide expression profiling, and a proliferation of "-seq"-based methods has permitted protein-protein and protein-DNA interactions to be determined cheaply and in a high-throughput manner. These data sets in turn allow us to generate hypotheses at the click of a mouse or tap of a finger.The Plant Bioinformatics Specialization on Coursera introduces core bioinformatic competencies and resources, such as NCBI's Genbank, Blast, multiple sequence alignments, phylogenetics in Bioinformatic Methods I, followed by protein-protein interaction, structural bioinformatics and RNA-seq analysis in Bioinformatic Methods II. In Plant Bioinformatics we cover 33 plant-specific online tools from genome browsers to transcriptomic data mining to promoter/network analyses and others. Last, a Plant Bioinformatics Capstone uses these tools to hypothesize a biological role for a gene of unknown function, summarized in a written lab report.This specialization is useful to any modern plant molecular biologist wanting to get a feeling for the incredible scope of data available to researchers. A small amount of R programming is introduced in Bioinformatic Methods II, but most of the tools are web applications. It is recommended that you have access to a laptop or desktop computer for running these as they may not work as mobile applications on your phone or tablet.
Perguntas Frequentes – FAQ
Quando terei acesso às palestras e às tarefas?
Access to lectures and assignments depends on your type of enrollment. If you take a course in audit mode, you will be able to see most course materials for free. To access graded assignments and to earn a Certificate, you will need to purchase the Certificate experience, during or after your audit. If you don't see the audit option:
- The course may not offer an audit option. You can try a Free Trial instead, or apply for Financial Aid.
- The course may offer 'Full Course, No Certificate' instead. This option lets you see all course materials, submit required assessments, and get a final grade. This also means that you will not be able to purchase a Certificate experience.
O que recebo ao me inscrever nesta Especialização?
Quando você se inscreve no curso, tem acesso a todos os cursos na Especialização e pode obter um certificado quando concluir o trabalho. Seu Certificado eletrônico será adicionado à sua página de Participações e você poderá imprimi-lo ou adicioná-lo ao seu perfil no LinkedIn. Se quiser apenas ler e assistir o conteúdo do curso, você poderá frequentá-lo como ouvinte sem custo.
Qual é a política de reembolso?
Se você se inscrever, terá 7 dias para testar sem custo e, durante este período, pode cancelar sem multa. Depois disso, não reembolsamos, mas você pode cancelar sua inscrição a qualquer momento. Veja nossa política para o reembolso total.
Existe algum auxílio financeiro disponível?
Sim, a Coursera oferece auxílio financeiro ao aluno que não possa pagar a taxa. Faça a solicitação clicando no link Auxílio Financeiro, abaixo do botão "Inscreva-se" à esquerda. Preencha uma solicitação e será notificado caso seja aprovado. Você terá que completar esta etapa para cada curso na Especialização, incluindo o Trabalho de Conclusão de Curso. Saiba mais .
Ganharei créditos universitários por concluir o curso?
Este curso não oferece créditos universitários, mas algumas universidades podem aceitar certificados de cursos que podem ser convertidos em créditos. Entre em contato com sua instituição para saber mais. Com os cursos on-line e os certificados Mastertrack™ do Coursera, é possível ganhar créditos universitários.
Mais dúvidas? Visite o Central de Ajuda ao Aprendiz.
