Informações sobre o curso
4.9
17 classificações
1 avaliações
100% online

100% online

Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.
Prazos flexíveis

Prazos flexíveis

Redefinir os prazos de acordo com sua programação.
Nível iniciante

Nível iniciante

Horas para completar

Aprox. 12 horas para completar

Sugerido: 6 недель, 3-8 часов в неделю...
Idiomas disponíveis

Russo

Legendas: Russo
100% online

100% online

Comece imediatamente e aprenda em seu próprio cronograma.
Prazos flexíveis

Prazos flexíveis

Redefinir os prazos de acordo com sua programação.
Nível iniciante

Nível iniciante

Horas para completar

Aprox. 12 horas para completar

Sugerido: 6 недель, 3-8 часов в неделю...
Idiomas disponíveis

Russo

Legendas: Russo

Programa - O que você aprenderá com este curso

Semana
1
Horas para completar
1 hora para concluir

Week 1 - Introduction (Введение)

The first week of our course will be dedicated to an overview of metagenomics. You will learn what metagenomics studies are and why this field of study has gained popularity in the current times. You will get acquainted with the basic approaches of metagenomic bioinformatics and with the specificity of the metagenomic analytical approaches used for the analysis of natural microbial communities. Первая неделя нашего курса знакомит с метагеномикой. Вы узнаете что изучает метагеномика и почему она возникла в наши дни. Вы познакомитесь с основными подходами метагеномной биоинформатики и особенностями аналитических подходов, применяемых для анализа природных микробных сообществ. ...
Reading
6 videos (Total 33 min)
Video6 videos
«Microbes run the World» (Микробы правят миром)3min
«Applications of Bioinformatics» (Биоинформатические приложения)8min
«Analytical Approaches» (Аналитические подходы)3min
«Metagenomic Project» (Метагеномный проект)8min
«Assembly of Metagenomes» (Сборка метагеномов)6min
Semana
2
Horas para completar
1 hora para concluir

Week 2 - Experimental Data (Экспериментальные данные)

Welcome to the second week of our course! This week is dedicated to experimental metagenomic data. We start with metagenomic DNA (mDNA) isolation and go on to sequencing and analysis to understand what is so special about this type of data. <br> Добро пожаловать на вторую неделю нашего курса! Эта неделя посвящена экспериментальным метагеномным данным. Мы пройдем от выделения метагеномной ДНК (мДНК) к ее секвенированию и анализу и поймем чем вызваны особенности этих данных и способов их получения. ...
Reading
7 videos (Total 46 min), 1 teste
Video7 videos
Metagenomic Approaches (Метагеномные подходы)5min
Sequencing Approaches (Подходы к секвенированию)7min
Analytical Pipelines (Аналитические подходы)5min
Target Sequencing (Таргетное секвенирование)6min
Sequencing Platforms (Сиквенсные платформы)8min
Bioinformatics Algorithms: Genome as a String (Биоинформатические алгоритмы: геном как строка)7min
Quiz1 exercício prático
Тест 1.20min
Semana
3
Horas para completar
1 hora para concluir

Week 3 - Analytical Approaches: 16s analysis (Аналитические подходы: анализ 16S)

This week we are going to explain how the analysis of the 16S rRNA gene sequences helps evaluate microbial diversity in metagenomic communities. You will learn about the databases that store already existing 16S sequences, and will be introduced to the analytical program QIIME, which will help you when you transition to working on metagenomic projects using real data. На этой неделе мы познакомим вас с тем, как анализ последовательностей генов 16S рРНК позволяет оценить микробное разнообразие метагеномных проб. Расскажем о базах данных, которые хранят накопленную уже информацию о 16S сиквенсах и представим аналитическую программу QIIME, которая будет вам весьма полезна в вашей работе с реальными данными метагеномных проектов. ...
Reading
4 videos (Total 41 min), 1 teste
Video4 videos
16S (16S рРНК)6min
16S Databases (Базы данных 16S)6min
Data Analysis in QIIME (Aнализ данных с помощью QIIME)18min
Quiz1 exercício prático
Тест 220min
Semana
4
Horas para completar
1 hora para concluir

Week 4 - Analytical Approaches: Binning (Аналитические подходы: биннинг)

Welcome to the fourth week of the course. It will be devoted to binning. Don’t know what that is? Then you will be even more interested to discover what the basis of this analytical approach is and how it helps simplify the analysis of very complex metagenomic data. Stay with us! Добро пожаловать на четвертую неделю курса. Она будет посвящена биннингу. Вы не знаете что это такое? Тогда вам тем более будет интересно узнать на чем основан этот аналитический подход и как он помогает упростить задачу анализа очень сложных метагеномных данных. Оставайтесь с нами! ...
Reading
5 videos (Total 43 min), 1 teste
Video5 videos
MyCC Binning Tool (Программа MyCC)8min
Binning Algorithms (Алгоритмы биннинга)10min
Supervised and Unsupervised Binning (Контролируемый и Неконтролируемый Биннинг)8min
Clustering (Кластеризация)7min
Quiz1 exercício prático
Тест 310min

Instrutores

Avatar

Alla L Lapidus

Professor, Department of Cytology and Histology
Centre For Algorithmic Biotechnology
Avatar

Михаил Райко

Постдок
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского
Avatar

Павел Добрынин

Младший научный сотрудник
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского
Avatar

Екатерина Черняева

Постдок
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского

Sobre Saint Petersburg State University

The Saint-Petersburg University (SPbU) is a state university, located in Saint-Petersburg, Russia. Founded in 1724, SPbU is the oldest institution of higher education in Russia. At present, there are more than 30 000 students in SPbU studying 398 programmes...

Perguntas Frequentes – FAQ

  • Ao se inscrever para um Certificado, você terá acesso a todos os vídeos, testes e tarefas de programação (se aplicável). Tarefas avaliadas pelos colegas apenas podem ser enviadas e avaliadas após o início da sessão. Caso escolha explorar o curso sem adquiri-lo, talvez você não consiga acessar certas tarefas.

  • Quando você adquire o Certificado, ganha acesso a todo o material do curso, incluindo avaliações com nota atribuída. Após concluir o curso, seu Certificado eletrônico será adicionado à sua página de Participações e você poderá imprimi-lo ou adicioná-lo ao seu perfil no LinkedIn. Se quiser apenas ler e assistir o conteúdo do curso, você poderá frequentá-lo como ouvinte sem custo.

Mais dúvidas? Visite o Central de Ajuda ao Aprendiz.